San Gimignano était au IIIème siècle av J.C., comme beaucoup de petits villages étrusques, situé sur un col dominant le Val d'Elsa.
Mais son histoire ne commence véritablement qu'autour du Xème siècle ap J.C., où elle prit le nom du saint évêque de Modène qui aurait défendu le village de l'occupation d'Attila.
Au moyen âge, San Gimignano jouit d'un extraordinaire développement grâce au commerce des très bons produits agricoles des collines toscanes.
En 1199, au cœur de sa splendeur économique, le pays gagna son indépendance sur les évêques de Volterra dont il était sujet, devenant une Commune de Toscane à part entière.
Comme d'autres communes, pendant cette période, elle fut divisée par les batailles entre Guelfes et Gibelins.
San Gimignano s'enrichit d'œuvres d'art et de superbes formes architecturales.
Le 8 mai 1300, la Commune eut l'honneur de recevoir comme ambassadeur de la Ligue Guelfe en Toscane Donato Alighieri.
La splendeur de la cité continua jusqu'en 1348, année où elle subit la peste noire qui infesta toute l'Europe et les famines qui en suivirent. Elle succomba à Florence, devenant ainsi une ville de seconde importance jusqu'à la fin du XIXème siècle lorsque l'on commença à redécouvrir la particularité et la beauté de sa ville médiévale et de ses produits agricoles, dont le premier entre tous, le vin